Spécialiste de la démographie historique, Hubert Charbonneau contribue à l’enrichissement du Registre de la population du Québec ancien (Programme de recherche en démographie historique). Ses travaux actuels portent sur les lieux d’origine des immigrants du Régime français, sur la composante amérindienne de la souche franco-québécoise, sur la descendance des Filles du roi en ce 350e anniversaire de leur arrivée en Nouvelle-France, de même que sur les liens entre démographie et généalogie.