L’ISSP a été fondé en octobre 2005, en remplacement de l'Unité d'enseignement et de recherche en démographie (UERD). L’ISSP figure parmi les 2 plus importants centres de formation d’Afrique francophone subsaharienne (avec l'IFORD au Cameroun) en démographie. L’ISSP a été nommé Centre d'excellence régional en population et santé par l'Union Économique et Monétaire Ouest Africaine (UEMOA). Jean-François Kobiané, directeur adjoint de l’institut, est président de l’Union pour l’étude de la population africaine, l’association des démographes de l’Afrique.
Le Département de démographie entretient avec l’ISSP/UERD depuis une vingtaine d’années des collaborations étroites en recherche et en formation et des relations d’appui importantes. Aujourd’hui, le Département administre, en partenariat avec l’USI, le programme de Renforcement des capacités en Afrique francophone subsaharienne, financé par la Fondation Bill & Melinda Gates. Le projet a entre autres permis le financement de 16 bourses de doctorat à l’Université de Montréal, la création d’un masters professionnel en population et santé à ISSP, et le renforcement général de ses infrastructures et des ses capacités de recherche et d’administration.